Non, tu as bien suivi la procédure. Les templates sont installés ailleurs en fait (pour des raisons de compatibilité avec Xcode < 4.3). Tu peux les trouver dans /Library/Developer/Xcode/Templates.
Après tu as deux solutions : soit éditer une fois pour toute ces templates, soit modifier directement les settings de tes projets (à faire une fois par projet). Comme tu préfères. Pour la première solution, tu as meilleur temps de les retélécharger depuis github car d'autres correctif on été appliqué depuis la RC.